FSH（卵胞刺激ホルモン）とLH（黄体形成ホルモン）の２つのホルモンの刺激を受け、卵巣にある卵胞（卵子を保護する小さな袋）が成長します。成熟卵胞からは卵胞ホルモン（エストロゲン）が分泌され、子宮内膜を増殖させます。また、基礎体温は比較的低温が続きます。

卵胞が育って卵胞ホルモン（エストロゲン）が増えると、脳下垂体からLH（黄体形成ホルモン）が急激に分泌されます。この影響で卵子が卵巣から排出されます。このとき、基礎体温は一旦やや下がり、その後高温相へ移ります。排卵のあと、排卵された卵子はその後、卵管内に進みます。

排卵後の卵胞は黄体という組織になり、黄体ホルモン（プロゲステロン）を作り始めます。この影響で、子宮内膜は妊娠に適した状態になり、また、基礎体温は比較的高温となります。

妊娠しなかった場合は、女性ホルモンの分泌量も減り、着床しやすくするため厚くなっていた子宮内膜がはがれ、月経となります。